同じ経験あります。
免許センターなどによって違うかもしれませんが。
出入国の飛行機チケットやeチケットが残っていたらそれで対応してくれる場合もあるそうです。
あと私が教えられた方法は出入国記録証明書、と言うものをお取り寄せできるとのこと。出入国記録の開示請求というものを郵送でできるようです。出入国在留管理庁の窓口での請求もしくは郵送による請求のいずれかのようです。
私も出国時のスタンプがなくてゴールド免許を失いました。が、次回の更新時に上記を申請して記録を取り寄せて提出したらゴールド免許が遡って復活できると言われたのでそうしようと思っています。