Visit Japan Webへの登録は任意です。内容も今は税関申告だけです。
私は、昨年も今年1月にも日本に一時帰国しましたが 、機内で以前と同じように税関申告用のカードを配っていましたし、私もそれを空港で提出しました。Visit Japan Webは使いませんでした。
QRコードはスクリーンショットで有効です。かえって表示時にトラブルが起きないようにスクリーンショットを撮っておくように推奨されています。
私の知り合いは、QRコードも申告書も用意して空港に着いたらすいている方の列に並ぶとか言っていました。